Barter 신드롬으로 진단 받을 뻔한 환자를 엑솜 시퀀싱을 통해 Congenital chloride diarrhea임을 밝힌 연구로 엑솜 시퀀싱을 진단 도구로 실제로 적용한 사례

지속적인 탈수현상과 체중증가부족 현상을 보이는 5세 아이를 Barter 신드롬으로 의심했으나 아이의 엑솜을 시퀀싱하여 선천적인 염화물 설사로 인한 장질환임을 밝혔다. 이 아이가 이 질환을 일으키는 1개의 유전자 SLC26A3에 missense 돌연변이를 갖고 있음을 확인하였다. 이 연구는 엑솜 시퀀싱을 통해 실제 진단에 응용할 수 있음을 보여주는 의미있는 연구이다.

Ng et al. 2009. Freeman-Sheldon syndrome(FSS)

Freeman-Sheldon syndrome 연구를 위해 비혈연 관계의 4명을 엑솜 시퀀싱하여 MYH3 유전자가 프리맨-쉘던 신드롬의 원인 유전자임을 규명한 사례

알려진 프리맨-쉘던 신드롬의 많은 후보 유전자 중에서 이 질환과 관련이 없는 변이들을 제거해나갔다. 우선, 시퀀싱한 환자의 엑솜의 Non-synonymous 코딩 SNPs, splice site, coding indels 영역을 조사하였다. 그 뒤 dbSNP와 HapMap의 8명의 엑솜에 등록된 common 변이를 필터링하였다. 이러한 과정을 통해 많은 프리맨-쉘던 신드롬의 후보 유전자 수를 의미있게 줄여나갔다. MYH3 유전자는 프리맨-쉘던 신드롬을 가진 4명 모두에게서 문제가 있고, 이 변이는 dbSNP와 HapMap 엑솜 데이터에 포함되지 않았다. 그러므로 열성 유전질환인 프리맨-쉘던 신드롬의 원인 유전자는 MYH3 유전자임을 확인하였다.

이 연구는 멘델리안 질환을 가진 소수의 비혈연 환자의 엑솜을 시퀀싱하는 것이 멘델리안 질환의 원인이 되는 유전자 발굴에 매우 유용함을 보여주었다. 

 

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